京台科技论坛从1998年开始，连续二十一年在京台两地举办大型活动。论坛紧紧围绕“为两岸关系和平发展大局服务，为首都经济社会发展服务”的中心任务，秉持“专业高端、特色实效、互利共赢”的原则，以“政府部门主导、两地协会对接、双方企业互动、专业机构服务”为机制，根据两岸关系大局和京台经济社会发展需要举办活动，包括峰会、专题论坛、项目签约、企业产品展示、交流餐会、参观考察和专项交流活动等。论坛成为两岸经贸交流合作平台、科技创新引领示范平台、社会融合发展展示平台。

1998年9月，首届京台科技论坛召开，时任全国政协副主席孙孚凌出席。2003年9月，中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林在人大大会堂会见出席京台科技论坛的台湾企业家。2008年至2010年，京台科技论坛连续三年在台成功举办，开启了京台两地举办论坛的新模式。从2011年开始，京台科技论坛正式改由国台办和北京市政府共同主办，并与北京台湾名品博览会联袂举办，取得了很好的效果，京台科技论坛的发展上升到了新的阶段。2011年11月，中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林在人民大会堂会见出席第十四届京台科技论坛的台湾企业家。2012年11月，全国政协主席贾庆林参观第十五届京台科技论坛暨北京台湾名品博览会。在北京举办的历届京台科技论坛，几乎均有北京市主要领导和国台办主要领导出席相关活动。

2013年至2016年，京台科技论坛以在台湾举办为主。2017年9月，第二十届京台科技论坛在京举办，北京市委书记蔡奇、代市长陈吉宁和国台办主任张志军出席活动。2018年8月，第二十一届京台科技论坛在京举办，北京市委副书记、市长陈吉宁和国台办主任刘结一出席活动。

在两岸有识之士的共同努力下，京台科技论坛促进了两岸高科技产业、现代制造业、金融业、现代服务业、文创产业、都市型观光休闲农业等领域的交流与合作，推动了两岸产业标准的研讨和制订，加深了台湾同胞对北京经济社会发展的关注和参与。经过多年发展，京台科技论坛成为两岸交流活动中持续时间长、影响范围广、岛内认可度高的最知名品牌活动之一，为促进京台经济交流合作与两岸关系和平发展做出了积极贡献。